Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SALL3Q9BXA9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SALL3Q9BXA9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms