Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SSBP4Q9BWG4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms