Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC39A3Q9BRY0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms