Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RBBP8Q99708 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBBP8Q99708 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms