Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PITX2Q99697 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms