Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIS3Q99687 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3Q99687 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms