Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF6Q99612 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms