Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARAP1Q96P48 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARAP1Q96P48 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms