Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TSNARE1Q96NA8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms