Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
JSRP1Q96MG2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
JSRP1Q96MG2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms