Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRIMPOLQ96LW4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRIMPOLQ96LW4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRIMPOLQ96LW4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRIMPOLQ96LW4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRIMPOLQ96LW4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRIMPOLQ96LW4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRIMPOLQ96LW4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRIMPOLQ96LW4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRIMPOLQ96LW4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms