Protein–RNA interactions for Protein: Q96JL9

ZNF333, Zinc finger protein 333, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF333Q96JL9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF333Q96JL9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms