Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms