Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC34Q96HJ3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC34Q96HJ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms