Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTUB1Q96FW1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms