Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM63Q969Q1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms