Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM54Q969K7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms