Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRG4Q92954 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRG4Q92954 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms