Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms