Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C11orf40Q8WZ69 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C11orf40Q8WZ69 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms