Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC112Q8NEF3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC112Q8NEF3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms