Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC197Q8NCU1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC197Q8NCU1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms