Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDCL2Q8N4E4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCL2Q8N4E4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms