Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LTBP4Q8N2S1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LTBP4Q8N2S1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms