Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJD3Q8N144 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms