Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PBRM1Q86U86 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PBRM1Q86U86 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms