Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NLRP9Q7RTR0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLRP9Q7RTR0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms