Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP43Q70EL4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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