Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XIRP1Q702N8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP1Q702N8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms