Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBR3Q6ZT12 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBR3Q6ZT12 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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