Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms