Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC171Q6TFL3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms