Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H3F3CQ6NXT2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H3F3CQ6NXT2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms