Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG9BQ674R7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms