Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FRMPD1Q5SYB0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms