Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms