Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms