Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EDRF1Q3B7T1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EDRF1Q3B7T1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms