Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F4Q16254 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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E2F4Q16254 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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E2F4Q16254 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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E2F4Q16254 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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E2F4Q16254 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F4Q16254 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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