Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1EQ15878 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms