Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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CCDC85BQ15834 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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CCDC85BQ15834 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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CCDC85BQ15834 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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CCDC85BQ15834 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC85BQ15834 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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