Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SF1Q15637 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SF1Q15637 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SF1Q15637 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SF1Q15637 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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