Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TAF1AQ15573 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF1AQ15573 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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