Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERC3Q15034 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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