Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms