Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCARB2Q14108 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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