Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2H3Q13889 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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GTF2H3Q13889 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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GTF2H3Q13889 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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GTF2H3Q13889 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H3Q13889 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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