Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTCH1Q13635 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
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