Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CUL1Q13616 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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