Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LSAMPQ13449 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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